無限長の時間軸を用意 サンプルサイズ n の点を時間軸上にランダム配置 時間軸を有限の長さの区間に分割し、ある区間について考える ある区間内に各点が含まれる確率を p とする 区間内の点の個数が k のとき、 k ~ Bionomial(N, p) となるので、 P(N = k) …

glmnetでは説明変数の個数に上限があるらしい。300個以上の説明変数をつかったモデルを組んだら、こんなエラーがでた。 Error: protect(): protection stack overflow同じことについて質問している人がいた。 https://stackoverflow.com/questions/32826906/…

なぜかhingeをfeatureに指定すると時々バグる https://groups.google.com/g/Maxent/c/PE_MCCqxEV4 https://github.com/jamiemkass/ENMeval/issues/57

在データしか手に入らない状況で、なんとか種分布モデルを構成したいときに、最近よく使われるようになっているmaxent。 総個体数が一定のある生物が限られた環境中（メッシュと読み替えても良い）に分布しており、各環境での個体数はその地点の環境要因と連…

maxentで使われるRパッケージにENMevalがある。ENMevalのバックエンドにはmaxnetを使われていて、さらにmaxnetのバックエンドにはglmnetが使われている。 ENMevalには正則化に関わるパラメタrm（regularization multipier。maxnetでいうとregmultという引数…